Program Studi MEP FEB UGM telah dan akan terus menjalin hubungan kerja sama dengan pihak internal lingkungan UGM dan pihak eksternal. Kerja sama dengan pihak internal yaitu hubungan kerja sama dengan fakultas atau pusat-pusat studi dan lembaga yang ada di lingkungan UGM, terutama dalam memanfaatkan hasil penelitian dan usaha melibatkan mahasiswa Program Studi MEP FEB UGM dalam penelitian yang dilakukan oleh lembaga-lembaga tersebut. Sementara itu, kerja sama dengan pihak eksternal dilakukan, baik nasional maupun internasional, yaitu:
1. Kerjasama Tingkat Nasional Program Studi MEP FEB UGM memiliki kerja sama dengan berbagai institusi pemerintah dan swasta dalam kegiatan pendidikan,penelitian dan pelatihan antara lain:
2. Kerjasama Tingkat Internasional
Program Studi MEP FEB UGM menjalin kerja sama dengan beberapa universitas di luar negeri dalam kegiatan pendidikan double degree, visiting professor dan joint research, diantaranya adalah
